魔法学園の中心を担う、魔法学園生徒会。 そこでは会長の真珠を中心に、珊瑚、瑠璃といったメンバーが、忙しくも賑やかな日々を送っていた。 そんなある時、闇の召喚士バロジカ率いる悪の魔法軍が、ジュエルズ帝国で暗躍を始める。 生徒会メンバーは、学園と世界の平和を守るべく、魔法軍へと立ち向かうのだった。